São Sebastião do Uatumã är en kommun i Brasilien. Den ligger i delstaten Amazonas, i den norra delen av landet, 1,900 km nordväst om huvudstaden Brasília. Antalet invånare är 10,688.
I omgivningarna runt São Sebastião do Uatumã växer i huvudsak städsegrön lövskog. Trakten runt São Sebastião do Uatumã är nära nog obefolkad, med mindre än två invånare per kvadratkilometer. Tropiskt monsunklimat råder i trakten. Årsmedeltemperaturen i trakten är 23 °C. Den varmaste månaden är september, då medeltemperaturen är 25 °C, och den kallaste är januari, med 22 °C. Genomsnittlig årsnederbörd är 2,874 millimeter. Den regnigaste månaden är mars, med i genomsnitt 477 mm nederbörd, och den torraste är september, med 79 mm nederbörd.